Gebenstorf befindet sich im Aargau, direkt am Zusammenfluss von Reuss, Aare und Limmat (Wasserschloss der Schweiz).

Die Wasserkraftanlage Gebenstorf ist die letzte von mehreren Wasserkraftanlagen in der Limmat. Am Streichwehr in der Limmat wird das Wasser gefasst und im Kanal durch das ehemalige BAG-Areal zum Maschinenhaus geführt. Der Unterwasserkanal mündet dann direkt ins Wasserschloss der Schweiz.